Если сотрудница ушла в декрет, то стандартные вычеты ей с этого месяца не предоставляются

Стандартные вычеты предоставляются налогоплательщику за каждый месяц налогового периода. Если в отдельные месяцы нет дохода, облагаемого НДФЛ по ставке 13 процентов, вычеты переносятся на следующие месяцы.

Если же сотруднику с определенного месяца полностью прекращается выплата дохода, например, в связи с уходом в декретный отпуск, и не возобновляется до окончания года, стандартный вычет за указанные месяцы не предоставляется.

(Письмо Минфина РФ от 06.05.2013 № 03-04-06/15669)